Международное сотрудничество филиала Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Душанбе направлено на расширение и развитие связей с университетами дальнего и ближнего зарубежья, научно-исследовательскими институтами, а также международными организациями. Оно осуществляется в рамках реализации межвузовских и международных образовательных программ и проектов, осуществления совместной научно-исследовательской деятельности, организации научно-практических семинаров и конференций, обмена преподавательскими кадрами и развития студенческой мобильности.

В рамках программы Silkroute (Шёлковый путь) по академической мобильности филиал Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Душанбе сотрудничает с такими высшими учебными заведениями-участниками как: Университет Падова (Италия), Университет Болонья (Италия), Университет Грац (Австрия), Университет Кантабрия (Испания), Университет Яши (Румыния), Университет Загреб (Хорватия). В рамках программы Tempus «Тюнинг: структура, формирование качества культуры» также существуют двусторонние партнерские отношения с высшими учебными заведениями дальнего и ближнего зарубежья по организации и участию в научно-практических семинарах и конференциях профессорско-преподавательского состава и сотрудников.

Налажено тесное сотрудничество с научно-исследовательскими институтами Академии наук Республики Таджикистан: Институтом математики, Институтом химии имени В.И. Никитина, Физико-техническим институтом имени С.У. Умарова.

Поддерживается связь с такими научно-образовательными организациями, как Германская служба академических обменов (DAAD), Европейская комиссия (Erasmus+), Международный совет по научным исследованиям и обменам (IREX), Институт «Открытое Общество» - Фонд Содействия в Таджикистане; культурный центр «Бактрия»; Баодинское учебно-подготовительное училище «Дэжунь» провинции Хэбэй Китайской Народной Республики.

При поддержке Посольства Российской Федерации в Республике Таджикистан и Представительства Россотрудничества в Таджикистане на базе филиала проводятся различные образовательные ярмарки, выставки и культурные мероприятия. В 2014 году на базе Филиала была организована и проведена III-я Международная выставка-ярмарка: «Российское образование. Душанбе-2014».

На основе совместного проекта с Представительством Фонда «Институт Евразийских Исследований» в Республике Таджикистан на базе Филиала создан и функционирует Межвузовский студенческий дискуссионный клуб, заседания которого регулярно проводятся на современные актуальные темы.

При филиале Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Душанбе функционирует Локальный центр тестирования в рамках деятельности Головного центра тестирования иностранных граждан по русскому языку Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова, который проводит государственное тестирование:

- по русскому языку как иностранному, в том числе и на гражданство;

- комплексный экзамен для иностранных граждан по русскому языку, истории России и основам законодательства Российской Федерации (для получения разрешения на работу в РФ или патента, вида на жительство или разрешения на временное проживание (РВП).

В истекшем календарном году Филиал Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Душанбе продолжил укрепление правовой базы сотрудничества с университетами дальнего и ближнего зарубежья. В результате проведенной работы были подписаны соглашения о сотрудничестве с Германским Technische Universitat Bergakademie Freiberg, Белорусским государственным университетом и Уфимским государственным нефтяным техническим университетом Российской Федерации.